딥러닝3 [논문리뷰]DISCo: Deep learning, Instance Segmentation, and Correlations for cellsegmentation in calcium imaging 이번 포스트에서는 Calcium Imaging과 관련된 segmention을 다룬 DISCo에 대해 공부한 것을 정리해보고자 한다. Abstract: 칼슘 이미징은 신경생리학에서 중요한 도구 중 하나이다. 이를 통해 단일 세포 해상도에서 수백 개의 세포들의 신경적 활동을 병렬적으로 관찰할 수 있기 때문이다. 칼슘 이미징을 통해 얻은 데이터를 사용하기 위해 녹화된 영상으로부터 개별 세포들의 활동을 추출해야 한다. 이를 위해 이 논문에서는 DISCo를 제안한다. DISCo는 픽셀 간의 상관관계를 계산하여 기록의 시간 정보를 계산적으로 효율적인 방식으로 사용하고 이를 형상 기반 정보와 결합하여 활성 및 비활성 셀을 식별한다. 처음에는 두 개의 픽셀이 하나의 세포에 속하는지 예측하는 것을 학습한다. 이를 통해 .. 2022. 11. 20. [파이토치]신경망 구성 이번 포스트에서는 본격적으로 우리가 흔히 모델로 알고 있는 신경망을 구축하는것을 알아보자. 아직 텐서변환에 대해 공부하지 않은 분들은 이전의 포스트를 먼저 보고 오면 도움이 될것이라고 생각한다. [파이토치] Transform 이번 포스트는 파이토치에서 학습을 위해 데이터를 처리의 한 부분인 Transform을 하는지 공부해 보자. Transform은 왜 필요하고 어떻게 할까? 머신러닝과 딥러닝에서 데이터를 학습에 용이하게 활용 dream-be.tistory.com 신경망은 데이터의 연산을 담당하는 레이어와 모듈로 이루어져 있다. torch.nn은 신경망을 구축하는데 필요한 모든 구성요소들을 제공한다. 파이토치가 제공하믄 모든 모듈은 nn.Module의 하위 클래스이다. 신경망은 그 자체가 다른 레이어와 .. 2022. 9. 29. Data Augmentation 개요 - 원본 이미지에 다양한 변형을 적용하여 이미지 데이터의 양을 증강시키는 방법 - 이미지 데이터는 다른 정형 데이터와 비교했을때, 확보가능한 데이터의 수가 적음 - 원본 이미지에 다양한 변형을 통해 이미지 데이터 개수를 늘리는 것과 같은 효과를 얻기 위함 - 원본 학습 이미지의 개수를 늘리는것이 아닌, 학습할 때마다 원본 이미지를 변형해서 학습을 수행 Data Augmention 유형 1. Spatial-Level Transform - 이미지 자체를 변형 - Flip: Vertical(상하반전), Horizontal(좌우반전) - Crop: Center, Random - Affine: Rotate(이미지방향 전환), Translate, Shear, Scale 2. Pixel_Level Transfo.. 2022. 1. 13. 이전 1 다음
